گروه راه و ساختمان - اختلاف وزارت راه و شهرسازی و سازمان امور مالیاتی در خصوص دریافت مالیات از خانه‌های خالی اجرای این قانون را با موانع فراوانی دچار کرده است. تنها یک روزتا پایان مهلت وزارت راه و شهرسازی برای ارسال لیست خانه‌های خالی به سازمان مالیاتی مانده است اما به گفته رئیس سازمان امور مالیاتی هنوز این لیست ارسال نشده و قرار است در پایان آذر این لیست به صورت کامل در اختیار این سازمان قرار گیرد. بر اساس قانون دریافت مالیات از خانه‌های خالی، واحدهای مسکونی در شهرهای با جمعیت بالای ۱۰۰ هزار نفر اگر ۱۲۰ روز در سال خالی باشد، مشمول پرداخت مالیات می‌شود که بر اساس آن در سال اول، دو و سوم به ترتیب ۶، ‌۱۲ و ۱۸ برابر مالیات متعلقه پرداخت کند.
به گزارش اقتصادسرآمد، جمع آوری این اطلاعات بر عهده وزارت راه وشهرسازی قرار گرفت و از مرداد سال گذشته در چندین نوبت با تمدید مهلت ثبت نام مواجه شد. معاون مسکن و ساختمان وزیر راه و شهرسازی ۲ میلیون و ۳۰۰ هزار واحد مسکونی خالی شناسایی شده است که از این میزان حدود یک میلیون واحد مربوط به اشخاص حقوقی است. وی همچنین از معرفی یک میلیون و ۳۰۰ هزار واحد مسکونی به سازمان امور مالیاتی خبر داد اما سازمان امور مالیاتی با رد این ادعا اعلام کرده است که هنوز برای دریافت لیست منتظر وزارت راه و شهرسازی است. 
سازمان مالیاتی اعتقاد دارد دریافت مالیات خانه‌های خالی بر اساس سیستم MPLS و طبق سند دولتی صورت گیرد به این شکل که راه‌اندازی سیستم میان وزارت راه و شهرسازی و سازمان امور مالیاتی با محوریت وزارت ارتباطات و فناوری تکمیل شود. اما معاون فنی و حقوقی سازمان امور مالیاتی درباره گفته‌های معاون وزیر راه و شهرسازی برای اخذ مالیات از خانه‌های خالی گفته است،« ۱.۳ میلیون واحد مسکونی خالی که معاون وزیر راه و شهرسازی اعلام کرده‌، اطلاعات آن‌ها به سازمان امور مالیاتی اعلام شده، در سیستم سازمان امور مالیاتی وجود ندارد، زیرا به موجب ماده ۵۴ مکرر قانون مالیات‌های مستقیم قبل از اصلاحیه سال ۱۳۹۹ باید یک واحد مسکونی حداقل یک سال خالی مانده باشد و از سال دوم به میزان ۵۰ درصد اجاره‌بها مشمول مالیات شود و مدت زمان خالی بودن خانه مورد نظر باید به سازمان امور مالیاتی با اطلاعات مربوطه اعلام شود».
فرآیند ثبت اطلاعات سکونتی و مالکیتی بدون اطلاع‌رسانی
مجتبی یوسفی عضو کمیسیون عمران مجلس در خصوص مشکلات سامانه املاک و اسکان می‌گوید: فرآیند ثبت اطلاعات سکونتی و مالکیتی بدون اطلاع‌رسانی و آگاه‌سازی کافی آغاز به کار کرد و به همین دلیل مورد استقبال مردم قرار نگرفت. همچنین دولت قبل اهتمام جدی برای به نتیجه رساندن این طرح نداشت.
قانون بعد از دو سال اجرا می‌شود
به گفته وی، سامانه املاک و اسکان نخستین زیرساخت مهم برای جمع‌آوری اطلاعات مربوط به واحد‌های مسکونی در کشور بود که چند سال مورد بی‌توجهی قرار گرفت و حتی بعد از راه‌اندازی هم، آگاه‌سازی مردم برای ثبت اطلاعات ملکی در این سامانه، آن قدر ضعیف بود که بسیاری از شهروندان از چگونگی ثبت اطلاعات ملکی در این سامانه بی‌خبر هستند.
یوسفی معتقد است: دولت علاوه بر این‌که قصد دارد تا قبل از پایان سال، قانون معطل مانده مالیات خانه‌های گرانقیمت و خالی را اجرا کند، همچنین در بودجه سال آینده نیز به این نوع مالیات پرداخته است. طبق لایحه بودجه ۱۴۰۱ دولت از واحد‌های مسکونی و باغ ویلا‌های بالای ۱۰ میلیارد تومان مالیات بر دارایی خواهد گرفت و درآمدی که از این محل برای خود پیش‌بینی کرده، ۷۰۰ میلیارد تومان است. 
پایان بهمن ماه قانون مالیات بر خانه‌های لوکس را اجرا می کنیم
یوسفی درباره اجرای قانون مالیات بر خانه‌های خالی می‌گوید: باید اطلاعات این خانه‌ها را از سامانه وزارت راه و شهرسازی دریافت کنیم که بر‌اساس آیین‌نامه مصوب دولت باید تا پایان آذر یعنی کمتر از ۱۰ روز دیگر اطلاعات قطعی در اختیار ما قرار گیرد.
او درباره مالیات خانه‌های لوکس نیز اظهارمی‌کند: در حال تکمیل بانک‌های اطلاعاتی هستیم و سامانه‌های لازم را ایجاد کرده‌ایم و مکاتبات لازم نیز با دستگاه‌های مختلف از جمله شهرداری‌ها برای دریافت اطلاعات انجام شده است و سعی می‌کنیم تا پایان بهمن قانون مالیات بر خانه‌های لوکس را اجرا کنیم.
تعلل دو ساله در اجرای قانون باعث شده تا یکی از قوانین مهم در جهت ساماندهی بازار مسکن هیچ تأثیری در این بازار نداشته باشد. اخذ مالیات از خانه‌های خالی، یا دریافت مالیات از معاملات مکرر مسکن سال‌هاست در بیشتر کشور‌های دنیا ابزاری برای کنترل قیمت و سوداگری در بازار مسکن است. با اینکه در کشور ما هم بعد از سال‌ها این ابزار مهم مالیاتی برای ساماندهی بازار مسکن مورد توجه قانونگذاران قرار گرفت، اما تعلل دولت در اجرای قانون نشان می‌دهد اخذ مالیات از خانه‌های لوکس و خانه‌های خالی تقریباً برابر صفر است.
بر‌اساس بند «خ» تبصره ۶ لایحه بودجه ۱۴۰۱ اولین نقل و انتقال قطعی ساختمان‌های نوساز اعم از مسکونی و غیر آن که بیش از ۳ سال از تاریخ احداث آن‌ها نگذشته باشد مشمول مالیات ۲.۵ درصدی خواهند شد. مأخذ محاسبه این پایه مالیاتی، میانگین قیمت‌های روز منطقه مبنای تعیین ارزش املاک که در ماده ۶۴ قانون مالیات‌های مستقیم آمده، در نظر گرفته شده است.  برنامه مالیاتی و افزایش ساخت و عرضه مسکن دو برنامه اصلی دولت در حوزه مسکن است تا اجرای این دو برنامه بتواند از یک طرف دلالی و سوداگری در مسکن را کاهش و از طرف دیگر با برقراری تعادل میان عرضه و تقاضا و همچنین حمایت از خانه دار شدن اقشار ضعیف، قیمت‌ها را در بازار مسکن و اجاره کنترل کند.